Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA6P23229 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms