Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD247P20963 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CD247P20963 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD247P20963 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CD247P20963 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD247P20963 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD247P20963 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD247P20963 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD247P20963 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD247P20963 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD247P20963 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD247P20963 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD247P20963 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD247P20963 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD247P20963 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD247P20963 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD247P20963 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD247P20963 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD247P20963 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD247P20963 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD247P20963 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD247P20963 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD247P20963 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD247P20963 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD247P20963 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD247P20963 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CD247P20963 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD247P20963 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD247P20963 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CD247P20963 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD247P20963 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD247P20963 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD247P20963 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD247P20963 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD247P20963 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CD247P20963 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD247P20963 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CD247P20963 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD247P20963 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD247P20963 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD247P20963 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD247P20963 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD247P20963 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD247P20963 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD247P20963 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD247P20963 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD247P20963 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD247P20963 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD247P20963 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD247P20963 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD247P20963 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD247P20963 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD247P20963 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD247P20963 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD247P20963 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD247P20963 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD247P20963 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD247P20963 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD247P20963 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD247P20963 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CD247P20963 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CD247P20963 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD247P20963 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD247P20963 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD247P20963 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD247P20963 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD247P20963 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD247P20963 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD247P20963 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD247P20963 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD247P20963 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD247P20963 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CD247P20963 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD247P20963 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD247P20963 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD247P20963 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD247P20963 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD247P20963 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD247P20963 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD247P20963 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD247P20963 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD247P20963 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD247P20963 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD247P20963 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD247P20963 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD247P20963 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD247P20963 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CD247P20963 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD247P20963 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD247P20963 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD247P20963 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD247P20963 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD247P20963 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CD247P20963 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD247P20963 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD247P20963 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CD247P20963 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD247P20963 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD247P20963 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD247P20963 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms