Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5AP20339 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms