Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LIG1P18858 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIG1P18858 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIG1P18858 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIG1P18858 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIG1P18858 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIG1P18858 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIG1P18858 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIG1P18858 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIG1P18858 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIG1P18858 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIG1P18858 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LIG1P18858 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIG1P18858 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIG1P18858 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIG1P18858 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIG1P18858 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIG1P18858 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIG1P18858 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIG1P18858 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LIG1P18858 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIG1P18858 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIG1P18858 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIG1P18858 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIG1P18858 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIG1P18858 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIG1P18858 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIG1P18858 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIG1P18858 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIG1P18858 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIG1P18858 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIG1P18858 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIG1P18858 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIG1P18858 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LIG1P18858 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIG1P18858 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIG1P18858 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIG1P18858 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIG1P18858 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIG1P18858 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIG1P18858 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIG1P18858 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIG1P18858 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIG1P18858 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIG1P18858 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIG1P18858 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIG1P18858 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIG1P18858 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LIG1P18858 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIG1P18858 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LIG1P18858 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIG1P18858 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIG1P18858 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIG1P18858 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LIG1P18858 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LIG1P18858 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIG1P18858 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIG1P18858 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIG1P18858 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIG1P18858 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIG1P18858 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIG1P18858 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIG1P18858 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIG1P18858 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIG1P18858 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIG1P18858 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIG1P18858 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIG1P18858 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIG1P18858 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIG1P18858 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIG1P18858 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIG1P18858 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIG1P18858 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LIG1P18858 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LIG1P18858 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIG1P18858 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIG1P18858 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIG1P18858 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIG1P18858 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIG1P18858 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIG1P18858 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIG1P18858 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIG1P18858 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIG1P18858 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIG1P18858 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LIG1P18858 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIG1P18858 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIG1P18858 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIG1P18858 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIG1P18858 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIG1P18858 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIG1P18858 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LIG1P18858 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LIG1P18858 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LIG1P18858 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LIG1P18858 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LIG1P18858 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LIG1P18858 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LIG1P18858 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LIG1P18858 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms