Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF3P18847 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF3P18847 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF3P18847 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF3P18847 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF3P18847 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF3P18847 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF3P18847 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF3P18847 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF3P18847 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF3P18847 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF3P18847 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF3P18847 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF3P18847 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF3P18847 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF3P18847 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF3P18847 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF3P18847 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF3P18847 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF3P18847 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF3P18847 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF3P18847 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF3P18847 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF3P18847 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF3P18847 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF3P18847 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF3P18847 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF3P18847 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF3P18847 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF3P18847 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF3P18847 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF3P18847 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF3P18847 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF3P18847 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF3P18847 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF3P18847 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF3P18847 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF3P18847 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF3P18847 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF3P18847 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF3P18847 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF3P18847 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF3P18847 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF3P18847 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF3P18847 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF3P18847 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF3P18847 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF3P18847 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF3P18847 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF3P18847 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF3P18847 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF3P18847 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF3P18847 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF3P18847 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF3P18847 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF3P18847 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF3P18847 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF3P18847 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF3P18847 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATF3P18847 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATF3P18847 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATF3P18847 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATF3P18847 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATF3P18847 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATF3P18847 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATF3P18847 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATF3P18847 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATF3P18847 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATF3P18847 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATF3P18847 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATF3P18847 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATF3P18847 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATF3P18847 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATF3P18847 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATF3P18847 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATF3P18847 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATF3P18847 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATF3P18847 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ATF3P18847 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ATF3P18847 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATF3P18847 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ATF3P18847 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ATF3P18847 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATF3P18847 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATF3P18847 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ATF3P18847 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATF3P18847 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATF3P18847 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATF3P18847 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATF3P18847 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATF3P18847 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATF3P18847 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATF3P18847 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATF3P18847 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF3P18847 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF3P18847 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF3P18847 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF3P18847 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF3P18847 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATF3P18847 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms