Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKCSHP14314 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCSHP14314 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms