Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HLA-DOBP13765 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms