Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms