Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARBP10826 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARBP10826 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RARBP10826 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARBP10826 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARBP10826 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARBP10826 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARBP10826 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RARBP10826 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RARBP10826 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RARBP10826 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARBP10826 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARBP10826 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARBP10826 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RARBP10826 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARBP10826 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARBP10826 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARBP10826 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARBP10826 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARBP10826 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARBP10826 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARBP10826 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARBP10826 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARBP10826 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARBP10826 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARBP10826 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARBP10826 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARBP10826 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARBP10826 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RARBP10826 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RARBP10826 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RARBP10826 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RARBP10826 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RARBP10826 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RARBP10826 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RARBP10826 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RARBP10826 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RARBP10826 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RARBP10826 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RARBP10826 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RARBP10826 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RARBP10826 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RARBP10826 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RARBP10826 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RARBP10826 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RARBP10826 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RARBP10826 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RARBP10826 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RARBP10826 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RARBP10826 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RARBP10826 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RARBP10826 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RARBP10826 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RARBP10826 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RARBP10826 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RARBP10826 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RARBP10826 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RARBP10826 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RARBP10826 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RARBP10826 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RARBP10826 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RARBP10826 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RARBP10826 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RARBP10826 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RARBP10826 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RARBP10826 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RARBP10826 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RARBP10826 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RARBP10826 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RARBP10826 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RARBP10826 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RARBP10826 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RARBP10826 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RARBP10826 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RARBP10826 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RARBP10826 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RARBP10826 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RARBP10826 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RARBP10826 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RARBP10826 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RARBP10826 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RARBP10826 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RARBP10826 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RARBP10826 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RARBP10826 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RARBP10826 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RARBP10826 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RARBP10826 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RARBP10826 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RARBP10826 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RARBP10826 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RARBP10826 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RARBP10826 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RARBP10826 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RARBP10826 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RARBP10826 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RARBP10826 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RARBP10826 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RARBP10826 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RARBP10826 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms