Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RD3LP0DJH9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms