Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms