Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMBP08118 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMBP08118 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMBP08118 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMBP08118 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMBP08118 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMBP08118 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMBP08118 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMBP08118 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMBP08118 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMBP08118 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMBP08118 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMBP08118 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMBP08118 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMBP08118 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMBP08118 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMBP08118 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMBP08118 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMBP08118 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMBP08118 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMBP08118 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMBP08118 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMBP08118 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMBP08118 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMBP08118 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMBP08118 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMBP08118 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMBP08118 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMBP08118 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMBP08118 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMBP08118 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMBP08118 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMBP08118 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMBP08118 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMBP08118 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMBP08118 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMBP08118 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMBP08118 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMBP08118 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMBP08118 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMBP08118 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMBP08118 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMBP08118 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSMBP08118 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMBP08118 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMBP08118 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMBP08118 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMBP08118 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMBP08118 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMBP08118 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMBP08118 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMBP08118 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMBP08118 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMBP08118 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMBP08118 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMBP08118 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMBP08118 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMBP08118 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMBP08118 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMBP08118 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMBP08118 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMBP08118 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMBP08118 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMBP08118 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMBP08118 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMBP08118 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMBP08118 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMBP08118 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMBP08118 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMBP08118 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMBP08118 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMBP08118 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMBP08118 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMBP08118 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMBP08118 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSMBP08118 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMBP08118 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMBP08118 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMBP08118 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMBP08118 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMBP08118 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMBP08118 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMBP08118 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMBP08118 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMBP08118 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMBP08118 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMBP08118 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMBP08118 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMBP08118 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMBP08118 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMBP08118 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMBP08118 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMBP08118 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMBP08118 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMBP08118 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMBP08118 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMBP08118 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMBP08118 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMBP08118 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSMBP08118 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms