Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NEFMP07197 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEFMP07197 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NEFMP07197 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEFMP07197 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEFMP07197 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFMP07197 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFMP07197 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFMP07197 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFMP07197 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFMP07197 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFMP07197 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFMP07197 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFMP07197 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFMP07197 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFMP07197 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFMP07197 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFMP07197 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFMP07197 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFMP07197 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFMP07197 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFMP07197 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFMP07197 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFMP07197 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFMP07197 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFMP07197 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFMP07197 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFMP07197 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFMP07197 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFMP07197 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFMP07197 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFMP07197 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFMP07197 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFMP07197 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFMP07197 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFMP07197 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFMP07197 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFMP07197 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFMP07197 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFMP07197 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFMP07197 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFMP07197 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFMP07197 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFMP07197 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFMP07197 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFMP07197 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFMP07197 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFMP07197 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFMP07197 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFMP07197 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFMP07197 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFMP07197 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFMP07197 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFMP07197 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFMP07197 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFMP07197 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFMP07197 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFMP07197 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFMP07197 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFMP07197 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFMP07197 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFMP07197 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFMP07197 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFMP07197 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFMP07197 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFMP07197 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFMP07197 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFMP07197 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFMP07197 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFMP07197 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFMP07197 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFMP07197 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFMP07197 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFMP07197 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFMP07197 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFMP07197 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFMP07197 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFMP07197 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFMP07197 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFMP07197 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFMP07197 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFMP07197 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFMP07197 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFMP07197 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFMP07197 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFMP07197 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFMP07197 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFMP07197 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFMP07197 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFMP07197 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFMP07197 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFMP07197 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFMP07197 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFMP07197 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFMP07197 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFMP07197 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFMP07197 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFMP07197 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFMP07197 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFMP07197 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms