Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APBA3O96018 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APBA3O96018 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APBA3O96018 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APBA3O96018 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APBA3O96018 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APBA3O96018 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APBA3O96018 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APBA3O96018 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APBA3O96018 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
APBA3O96018 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
APBA3O96018 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APBA3O96018 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APBA3O96018 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
APBA3O96018 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APBA3O96018 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APBA3O96018 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APBA3O96018 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APBA3O96018 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APBA3O96018 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APBA3O96018 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APBA3O96018 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
APBA3O96018 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
APBA3O96018 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APBA3O96018 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APBA3O96018 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APBA3O96018 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APBA3O96018 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APBA3O96018 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APBA3O96018 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APBA3O96018 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APBA3O96018 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APBA3O96018 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APBA3O96018 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APBA3O96018 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APBA3O96018 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APBA3O96018 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APBA3O96018 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APBA3O96018 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APBA3O96018 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APBA3O96018 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APBA3O96018 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APBA3O96018 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APBA3O96018 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APBA3O96018 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APBA3O96018 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APBA3O96018 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APBA3O96018 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APBA3O96018 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APBA3O96018 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APBA3O96018 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APBA3O96018 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APBA3O96018 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
APBA3O96018 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APBA3O96018 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APBA3O96018 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
APBA3O96018 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APBA3O96018 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APBA3O96018 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APBA3O96018 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APBA3O96018 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APBA3O96018 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
APBA3O96018 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
APBA3O96018 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APBA3O96018 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
APBA3O96018 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APBA3O96018 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APBA3O96018 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
APBA3O96018 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APBA3O96018 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APBA3O96018 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APBA3O96018 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APBA3O96018 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APBA3O96018 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APBA3O96018 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APBA3O96018 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APBA3O96018 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APBA3O96018 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APBA3O96018 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
APBA3O96018 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APBA3O96018 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
APBA3O96018 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APBA3O96018 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
APBA3O96018 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
APBA3O96018 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APBA3O96018 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
APBA3O96018 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APBA3O96018 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APBA3O96018 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APBA3O96018 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APBA3O96018 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APBA3O96018 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APBA3O96018 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APBA3O96018 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APBA3O96018 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
APBA3O96018 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APBA3O96018 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
APBA3O96018 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APBA3O96018 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APBA3O96018 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms