Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24BO95487 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms