Protein–RNA interactions for Protein: O94907

DKK1, Dickkopf-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK1O94907 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK1O94907 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK1O94907 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK1O94907 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK1O94907 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK1O94907 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK1O94907 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK1O94907 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK1O94907 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK1O94907 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK1O94907 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK1O94907 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK1O94907 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK1O94907 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK1O94907 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK1O94907 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK1O94907 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK1O94907 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK1O94907 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK1O94907 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK1O94907 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK1O94907 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK1O94907 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK1O94907 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK1O94907 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK1O94907 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK1O94907 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK1O94907 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK1O94907 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK1O94907 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK1O94907 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK1O94907 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK1O94907 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK1O94907 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK1O94907 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK1O94907 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK1O94907 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK1O94907 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK1O94907 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK1O94907 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK1O94907 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK1O94907 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK1O94907 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK1O94907 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK1O94907 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK1O94907 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK1O94907 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DKK1O94907 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DKK1O94907 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DKK1O94907 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DKK1O94907 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DKK1O94907 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DKK1O94907 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DKK1O94907 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
DKK1O94907 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DKK1O94907 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DKK1O94907 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK1O94907 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK1O94907 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK1O94907 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK1O94907 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK1O94907 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK1O94907 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK1O94907 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK1O94907 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK1O94907 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK1O94907 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK1O94907 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK1O94907 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK1O94907 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK1O94907 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK1O94907 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK1O94907 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK1O94907 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK1O94907 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK1O94907 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK1O94907 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK1O94907 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK1O94907 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK1O94907 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK1O94907 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK1O94907 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK1O94907 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK1O94907 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK1O94907 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK1O94907 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK1O94907 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK1O94907 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK1O94907 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK1O94907 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK1O94907 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK1O94907 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK1O94907 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK1O94907 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK1O94907 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK1O94907 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK1O94907 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK1O94907 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK1O94907 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK1O94907 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms