Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX3O75364 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX3O75364 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX3O75364 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX3O75364 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX3O75364 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX3O75364 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX3O75364 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX3O75364 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX3O75364 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX3O75364 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX3O75364 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX3O75364 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX3O75364 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX3O75364 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX3O75364 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX3O75364 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX3O75364 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX3O75364 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX3O75364 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX3O75364 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX3O75364 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX3O75364 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX3O75364 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX3O75364 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX3O75364 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX3O75364 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX3O75364 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX3O75364 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX3O75364 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX3O75364 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX3O75364 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX3O75364 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX3O75364 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX3O75364 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX3O75364 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX3O75364 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX3O75364 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX3O75364 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX3O75364 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX3O75364 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX3O75364 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX3O75364 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX3O75364 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX3O75364 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX3O75364 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX3O75364 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX3O75364 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX3O75364 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX3O75364 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX3O75364 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX3O75364 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX3O75364 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX3O75364 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX3O75364 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX3O75364 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX3O75364 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX3O75364 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX3O75364 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX3O75364 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX3O75364 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX3O75364 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX3O75364 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX3O75364 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX3O75364 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX3O75364 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX3O75364 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX3O75364 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX3O75364 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX3O75364 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX3O75364 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX3O75364 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX3O75364 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX3O75364 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX3O75364 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX3O75364 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX3O75364 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX3O75364 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX3O75364 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX3O75364 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX3O75364 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX3O75364 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX3O75364 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX3O75364 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX3O75364 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX3O75364 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX3O75364 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX3O75364 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX3O75364 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX3O75364 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX3O75364 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX3O75364 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX3O75364 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX3O75364 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX3O75364 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX3O75364 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX3O75364 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX3O75364 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX3O75364 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX3O75364 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms