Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM4AO75164 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms