Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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PRAMEF10O60809 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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PRAMEF10O60809 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PRAMEF10O60809 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PRAMEF10O60809 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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PRAMEF10O60809 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF10O60809 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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