Protein–RNA interactions for Protein: O60522

TDRD6, Tudor domain-containing protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD6O60522 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD6O60522 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms