Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPAG9O60271 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms