Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX15O60248 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX15O60248 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX15O60248 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX15O60248 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX15O60248 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX15O60248 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX15O60248 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX15O60248 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX15O60248 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX15O60248 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX15O60248 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX15O60248 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX15O60248 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX15O60248 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX15O60248 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX15O60248 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX15O60248 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX15O60248 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX15O60248 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX15O60248 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX15O60248 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX15O60248 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX15O60248 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX15O60248 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX15O60248 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX15O60248 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX15O60248 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX15O60248 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX15O60248 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX15O60248 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX15O60248 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX15O60248 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX15O60248 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX15O60248 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOX15O60248 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX15O60248 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX15O60248 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX15O60248 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX15O60248 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX15O60248 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX15O60248 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX15O60248 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX15O60248 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX15O60248 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX15O60248 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX15O60248 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX15O60248 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX15O60248 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX15O60248 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX15O60248 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX15O60248 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX15O60248 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX15O60248 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX15O60248 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX15O60248 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX15O60248 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX15O60248 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX15O60248 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX15O60248 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX15O60248 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX15O60248 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX15O60248 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX15O60248 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX15O60248 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX15O60248 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX15O60248 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX15O60248 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX15O60248 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX15O60248 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX15O60248 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX15O60248 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOX15O60248 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX15O60248 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX15O60248 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX15O60248 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX15O60248 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX15O60248 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX15O60248 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX15O60248 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX15O60248 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX15O60248 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX15O60248 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX15O60248 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX15O60248 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX15O60248 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX15O60248 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX15O60248 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX15O60248 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX15O60248 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SOX15O60248 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOX15O60248 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOX15O60248 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOX15O60248 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOX15O60248 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOX15O60248 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOX15O60248 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOX15O60248 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOX15O60248 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOX15O60248 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms