Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXO3O43524 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
FOXO3O43524 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms