Protein–RNA interactions for Protein: O15541

RNF113A, RING finger protein 113A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF113AO15541 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF113AO15541 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF113AO15541 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF113AO15541 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF113AO15541 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF113AO15541 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms