Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms