Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms