Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP9YO00507 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP9YO00507 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP9YO00507 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
USP9YO00507 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP9YO00507 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP9YO00507 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
USP9YO00507 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP9YO00507 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP9YO00507 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP9YO00507 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP9YO00507 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP9YO00507 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP9YO00507 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP9YO00507 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP9YO00507 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP9YO00507 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP9YO00507 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9YO00507 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9YO00507 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9YO00507 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9YO00507 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9YO00507 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9YO00507 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9YO00507 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9YO00507 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9YO00507 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9YO00507 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9YO00507 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9YO00507 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9YO00507 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9YO00507 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9YO00507 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9YO00507 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9YO00507 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9YO00507 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9YO00507 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9YO00507 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9YO00507 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9YO00507 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9YO00507 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9YO00507 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9YO00507 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9YO00507 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9YO00507 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9YO00507 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9YO00507 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9YO00507 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9YO00507 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9YO00507 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9YO00507 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9YO00507 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9YO00507 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9YO00507 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9YO00507 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9YO00507 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9YO00507 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9YO00507 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9YO00507 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9YO00507 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9YO00507 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9YO00507 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9YO00507 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9YO00507 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9YO00507 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9YO00507 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9YO00507 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9YO00507 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9YO00507 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9YO00507 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9YO00507 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9YO00507 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9YO00507 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9YO00507 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9YO00507 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9YO00507 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9YO00507 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9YO00507 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9YO00507 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9YO00507 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9YO00507 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9YO00507 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9YO00507 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9YO00507 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9YO00507 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP9YO00507 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP9YO00507 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP9YO00507 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP9YO00507 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP9YO00507 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP9YO00507 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP9YO00507 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP9YO00507 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP9YO00507 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP9YO00507 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP9YO00507 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP9YO00507 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP9YO00507 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP9YO00507 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP9YO00507 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms