Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PIK3C2AO00443 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3C2AO00443 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms