Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01387J3KSC0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms