Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3BA8MYP8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms