Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRAMEF25A6NGN4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms