Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GOLGA6L9A6NEM1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms