Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM247A6NEH6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM247A6NEH6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM247A6NEH6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM247A6NEH6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM247A6NEH6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM247A6NEH6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM247A6NEH6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM247A6NEH6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms