Protein–RNA interactions for Protein: A0A0C4DH30

IGHV3-16, Immunoglobulin heavy variable 3-16 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-16A0A0C4DH30 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IGHV3-16A0A0C4DH30 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IGHV3-16A0A0C4DH30 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IGHV3-16A0A0C4DH30 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IGHV3-16A0A0C4DH30 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IGHV3-16A0A0C4DH30 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IGHV3-16A0A0C4DH30 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IGHV3-16A0A0C4DH30 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IGHV3-16A0A0C4DH30 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IGHV3-16A0A0C4DH30 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IGHV3-16A0A0C4DH30 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IGHV3-16A0A0C4DH30 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IGHV3-16A0A0C4DH30 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
IGHV3-16A0A0C4DH30 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IGHV3-16A0A0C4DH30 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IGHV3-16A0A0C4DH30 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IGHV3-16A0A0C4DH30 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IGHV3-16A0A0C4DH30 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IGHV3-16A0A0C4DH30 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IGHV3-16A0A0C4DH30 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IGHV3-16A0A0C4DH30 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IGHV3-16A0A0C4DH30 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IGHV3-16A0A0C4DH30 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IGHV3-16A0A0C4DH30 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IGHV3-16A0A0C4DH30 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IGHV3-16A0A0C4DH30 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IGHV3-16A0A0C4DH30 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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IGHV3-16A0A0C4DH30 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IGHV3-16A0A0C4DH30 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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IGHV3-16A0A0C4DH30 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IGHV3-16A0A0C4DH30 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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IGHV3-16A0A0C4DH30 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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IGHV3-16A0A0C4DH30 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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IGHV3-16A0A0C4DH30 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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IGHV3-16A0A0C4DH30 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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IGHV3-16A0A0C4DH30 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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IGHV3-16A0A0C4DH30 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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IGHV3-16A0A0C4DH30 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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IGHV3-16A0A0C4DH30 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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IGHV3-16A0A0C4DH30 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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IGHV3-16A0A0C4DH30 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IGHV3-16A0A0C4DH30 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IGHV3-16A0A0C4DH30 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IGHV3-16A0A0C4DH30 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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IGHV3-16A0A0C4DH30 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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