Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ9

KRTAP4-8, Keratin-associated protein 4-8, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-8Q9BYQ9 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 OR4K17-203ENST00000641633 5068 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 MAVS-202ENST00000428216 11714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 KCNMA1-212ENST00000406533 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 GABPB2-202ENST00000368918 8964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 NBPF12-203ENST00000611443 5594 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 E2F8-201ENST00000250024 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 VWA3A-202ENST00000389398 4600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 PHIP-201ENST00000275034 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 MR1-204ENST00000367580 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 TTTY15-202ENST00000440408 5284 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 LIG3-202ENST00000378526 8400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 FARP1-219ENST00000596580 13532 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 SLC35E3-202ENST00000398004 17791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC011525.1-201ENST00000562167 5676 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 LIPG-201ENST00000261292 10441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-8Q9BYQ9 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.2 ms