Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
MAP3K4Q9Y6R4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MAP3K4Q9Y6R4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms