Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AUP1Q9Y679 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms