Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.39■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
DCAF1Q9Y4B6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC36.34■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
DCAF1Q9Y4B6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms