Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COG6Q9Y2V7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COG6Q9Y2V7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms