Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1DQ9Y2S0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms