Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms