Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms