Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHOC2Q9UQ13 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms