Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTF2Q9UNY4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms