Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms