Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA11Q9UKX5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGA11Q9UKX5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGA11Q9UKX5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms