Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PARP4Q9UKK3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms