Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIMS3Q9UJD0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms