Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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COPS7AQ9UBW8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
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COPS7AQ9UBW8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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COPS7AQ9UBW8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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COPS7AQ9UBW8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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COPS7AQ9UBW8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
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