Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DKK4Q9UBT3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms